GoGlobal  (Graphon.com)

Otra opción es usar una capa de abstracción Windows en el ambiente Linux. Para ello existeWine, un proyecto Open-Source cuyo objetivo crear una capa Windows para aplicaciones Windows, dentro del ambiente Linux. Es una tecnología funcional pero NO todas las aplicaciones son compatibles. El uso de esta oción requiere de prueba, validación y recursos de hardware para el caso del  servidor terminal. Esto porque a veces el software Se atasca durante su ejecución y al tratarse de un ambiente multiusuario (LTSP) el  procesador del sistema se va al 100% de su utilización, atascando la multitarea suave para las demás actividades. El uso de este recurso requiere de pruebas previas y que la aplicación(es) sea(n) compatible(s) con Wine. Con el uso de este tipo de opción no se requiere licencia para el sistema operativo Windows. Dos productos que se encuentran dentro de esta categoría son:

WineHQ (Open-Source)
CrossoverOffice (codeweavers.com * software comercial)

Tal vez un poco fuera de lugar respecto al requerimiento inicialmente indicado, puedes tomar en cuenta la opción de la virtualización, sea para poner en producción un ambiente de servidor Windows a fin de montar un ambiente Windows completo, o crear un entorno virtual Windows para su uso comoestación de trabajo.  En el ámbito de la virtualización se requieren muchos recursos de parte de los sistemas, y salvo que sea un servidor muy potente no veo práctico el montar dicho entorno sobre un servidor de terminales.

Todo depende de los recursos tecnologícos que desees o puedas utilizar.